Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN7AQ01118 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms