Protein–RNA interactions for Protein: P78426

NKX6-1, Homeobox protein Nkx-6.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-1P78426 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX6-1P78426 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms