Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms