Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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