Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVPABLB-1P60509 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms