Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK1P57059 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK1P57059 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK1P57059 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK1P57059 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK1P57059 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK1P57059 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK1P57059 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK1P57059 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK1P57059 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK1P57059 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK1P57059 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK1P57059 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK1P57059 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK1P57059 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK1P57059 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK1P57059 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK1P57059 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK1P57059 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK1P57059 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK1P57059 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK1P57059 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK1P57059 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIK1P57059 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK1P57059 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK1P57059 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK1P57059 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK1P57059 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK1P57059 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK1P57059 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK1P57059 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK1P57059 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK1P57059 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK1P57059 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK1P57059 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK1P57059 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK1P57059 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK1P57059 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK1P57059 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK1P57059 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK1P57059 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK1P57059 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK1P57059 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK1P57059 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIK1P57059 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK1P57059 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK1P57059 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK1P57059 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK1P57059 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK1P57059 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK1P57059 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK1P57059 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK1P57059 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK1P57059 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK1P57059 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK1P57059 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK1P57059 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK1P57059 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK1P57059 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK1P57059 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK1P57059 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK1P57059 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK1P57059 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK1P57059 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK1P57059 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK1P57059 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK1P57059 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK1P57059 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK1P57059 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK1P57059 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIK1P57059 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIK1P57059 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIK1P57059 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIK1P57059 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIK1P57059 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIK1P57059 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIK1P57059 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIK1P57059 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIK1P57059 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIK1P57059 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIK1P57059 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIK1P57059 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SIK1P57059 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIK1P57059 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIK1P57059 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIK1P57059 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIK1P57059 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIK1P57059 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIK1P57059 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIK1P57059 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIK1P57059 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIK1P57059 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIK1P57059 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIK1P57059 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIK1P57059 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIK1P57059 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIK1P57059 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIK1P57059 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIK1P57059 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIK1P57059 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms