Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF1P55201 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms