Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD23AP54725 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms