Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms