Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CRISP1P54107 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms