Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DAP3P51398 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DAP3P51398 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DAP3P51398 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DAP3P51398 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DAP3P51398 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DAP3P51398 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DAP3P51398 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DAP3P51398 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DAP3P51398 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DAP3P51398 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DAP3P51398 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DAP3P51398 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DAP3P51398 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DAP3P51398 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DAP3P51398 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DAP3P51398 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DAP3P51398 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DAP3P51398 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DAP3P51398 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DAP3P51398 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DAP3P51398 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DAP3P51398 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DAP3P51398 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DAP3P51398 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DAP3P51398 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DAP3P51398 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DAP3P51398 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DAP3P51398 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DAP3P51398 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DAP3P51398 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DAP3P51398 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DAP3P51398 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DAP3P51398 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DAP3P51398 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DAP3P51398 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DAP3P51398 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DAP3P51398 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DAP3P51398 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DAP3P51398 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DAP3P51398 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DAP3P51398 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DAP3P51398 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DAP3P51398 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DAP3P51398 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DAP3P51398 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DAP3P51398 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DAP3P51398 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DAP3P51398 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DAP3P51398 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DAP3P51398 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DAP3P51398 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DAP3P51398 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DAP3P51398 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DAP3P51398 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DAP3P51398 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms