Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms