Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTRNP46939 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UTRNP46939 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTRNP46939 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTRNP46939 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTRNP46939 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTRNP46939 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTRNP46939 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTRNP46939 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTRNP46939 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTRNP46939 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UTRNP46939 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTRNP46939 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTRNP46939 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTRNP46939 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTRNP46939 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTRNP46939 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTRNP46939 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTRNP46939 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTRNP46939 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UTRNP46939 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTRNP46939 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTRNP46939 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTRNP46939 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTRNP46939 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTRNP46939 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UTRNP46939 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTRNP46939 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTRNP46939 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTRNP46939 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTRNP46939 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UTRNP46939 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTRNP46939 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTRNP46939 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTRNP46939 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTRNP46939 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTRNP46939 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTRNP46939 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTRNP46939 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTRNP46939 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UTRNP46939 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTRNP46939 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTRNP46939 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTRNP46939 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTRNP46939 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTRNP46939 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTRNP46939 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTRNP46939 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTRNP46939 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTRNP46939 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTRNP46939 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTRNP46939 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTRNP46939 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UTRNP46939 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTRNP46939 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTRNP46939 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTRNP46939 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UTRNP46939 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTRNP46939 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTRNP46939 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTRNP46939 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTRNP46939 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTRNP46939 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTRNP46939 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTRNP46939 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTRNP46939 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTRNP46939 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UTRNP46939 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTRNP46939 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTRNP46939 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTRNP46939 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTRNP46939 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTRNP46939 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTRNP46939 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTRNP46939 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTRNP46939 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTRNP46939 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTRNP46939 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTRNP46939 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTRNP46939 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTRNP46939 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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