Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGP37231 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPARGP37231 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPARGP37231 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPARGP37231 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPARGP37231 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPARGP37231 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPARGP37231 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPARGP37231 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPARGP37231 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGP37231 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGP37231 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGP37231 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGP37231 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGP37231 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGP37231 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGP37231 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGP37231 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGP37231 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGP37231 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGP37231 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGP37231 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGP37231 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGP37231 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGP37231 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGP37231 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGP37231 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPARGP37231 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms