Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
THBS4P35443 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
THBS4P35443 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
THBS4P35443 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
THBS4P35443 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
THBS4P35443 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
THBS4P35443 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
THBS4P35443 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
THBS4P35443 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
THBS4P35443 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
THBS4P35443 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
THBS4P35443 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
THBS4P35443 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
THBS4P35443 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
THBS4P35443 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
THBS4P35443 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
THBS4P35443 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
THBS4P35443 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
THBS4P35443 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
THBS4P35443 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
THBS4P35443 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
THBS4P35443 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
THBS4P35443 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
THBS4P35443 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
THBS4P35443 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms