Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPDP35247 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms