Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms