Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHC1P29353 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHC1P29353 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHC1P29353 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHC1P29353 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SHC1P29353 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SHC1P29353 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHC1P29353 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms