Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD34P28906 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD34P28906 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD34P28906 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD34P28906 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD34P28906 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD34P28906 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD34P28906 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD34P28906 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD34P28906 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD34P28906 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD34P28906 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD34P28906 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CD34P28906 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD34P28906 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD34P28906 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD34P28906 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD34P28906 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD34P28906 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD34P28906 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD34P28906 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD34P28906 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD34P28906 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CD34P28906 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms