Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFKBIAP25963 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms