Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
YY1P25490 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YY1P25490 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
YY1P25490 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
YY1P25490 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
YY1P25490 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YY1P25490 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
YY1P25490 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
YY1P25490 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
YY1P25490 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YY1P25490 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YY1P25490 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YY1P25490 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
YY1P25490 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
YY1P25490 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
YY1P25490 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YY1P25490 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YY1P25490 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YY1P25490 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
YY1P25490 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YY1P25490 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YY1P25490 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YY1P25490 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YY1P25490 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YY1P25490 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YY1P25490 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YY1P25490 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YY1P25490 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YY1P25490 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
YY1P25490 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YY1P25490 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
YY1P25490 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
YY1P25490 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YY1P25490 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
YY1P25490 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YY1P25490 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YY1P25490 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YY1P25490 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YY1P25490 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YY1P25490 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
YY1P25490 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
YY1P25490 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
YY1P25490 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms