Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA1P25391 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms