Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5F1P24539 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms