Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA6P23229 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms