Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCL3P20749 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCL3P20749 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BCL3P20749 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCL3P20749 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCL3P20749 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCL3P20749 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
BCL3P20749 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCL3P20749 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCL3P20749 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BCL3P20749 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCL3P20749 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCL3P20749 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCL3P20749 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BCL3P20749 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCL3P20749 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCL3P20749 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCL3P20749 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
BCL3P20749 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCL3P20749 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BCL3P20749 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCL3P20749 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BCL3P20749 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCL3P20749 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCL3P20749 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms