Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms