Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF4P15884 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF4P15884 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF4P15884 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF4P15884 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF4P15884 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF4P15884 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF4P15884 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF4P15884 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF4P15884 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF4P15884 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF4P15884 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF4P15884 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF4P15884 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF4P15884 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF4P15884 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF4P15884 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF4P15884 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF4P15884 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF4P15884 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF4P15884 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF4P15884 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF4P15884 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF4P15884 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF4P15884 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF4P15884 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF4P15884 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF4P15884 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF4P15884 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF4P15884 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF4P15884 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF4P15884 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF4P15884 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF4P15884 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCF4P15884 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms