Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD46P15529 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD46P15529 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD46P15529 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD46P15529 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms