Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms