Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC130P13994 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms