Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHGAP10645 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHGAP10645 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHGAP10645 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHGAP10645 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHGAP10645 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHGAP10645 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHGAP10645 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHGAP10645 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHGAP10645 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHGAP10645 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHGAP10645 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHGAP10645 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHGAP10645 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHGAP10645 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHGAP10645 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CHGAP10645 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHGAP10645 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHGAP10645 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHGAP10645 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHGAP10645 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHGAP10645 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHGAP10645 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHGAP10645 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHGAP10645 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHGAP10645 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHGAP10645 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHGAP10645 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHGAP10645 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHGAP10645 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHGAP10645 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHGAP10645 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHGAP10645 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHGAP10645 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHGAP10645 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHGAP10645 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHGAP10645 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CHGAP10645 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHGAP10645 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHGAP10645 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHGAP10645 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CHGAP10645 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHGAP10645 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHGAP10645 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHGAP10645 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHGAP10645 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHGAP10645 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHGAP10645 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHGAP10645 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHGAP10645 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHGAP10645 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHGAP10645 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHGAP10645 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHGAP10645 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHGAP10645 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHGAP10645 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHGAP10645 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHGAP10645 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CHGAP10645 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHGAP10645 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHGAP10645 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHGAP10645 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHGAP10645 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHGAP10645 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHGAP10645 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHGAP10645 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHGAP10645 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHGAP10645 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms