Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NR2F1P10589 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR2F1P10589 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms