Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI4P10075 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GLI4P10075 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
GLI4P10075 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GLI4P10075 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms