Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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