Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPBP07988 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms