Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APODP05090 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APODP05090 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APODP05090 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APODP05090 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APODP05090 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APODP05090 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
APODP05090 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APODP05090 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APODP05090 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APODP05090 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APODP05090 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APODP05090 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APODP05090 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APODP05090 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APODP05090 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms