Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TK1P04183 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TK1P04183 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TK1P04183 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TK1P04183 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TK1P04183 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TK1P04183 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TK1P04183 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TK1P04183 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TK1P04183 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TK1P04183 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TK1P04183 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TK1P04183 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TK1P04183 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TK1P04183 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TK1P04183 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TK1P04183 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TK1P04183 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TK1P04183 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TK1P04183 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TK1P04183 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TK1P04183 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TK1P04183 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TK1P04183 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TK1P04183 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TK1P04183 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TK1P04183 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TK1P04183 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms