Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PF4P02776 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PF4P02776 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PF4P02776 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PF4P02776 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PF4P02776 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PF4P02776 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PF4P02776 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PF4P02776 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PF4P02776 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PF4P02776 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PF4P02776 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PF4P02776 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PF4P02776 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PF4P02776 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PF4P02776 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PF4P02776 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PF4P02776 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PF4P02776 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PF4P02776 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PF4P02776 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PF4P02776 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PF4P02776 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PF4P02776 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PF4P02776 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PF4P02776 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PF4P02776 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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PF4P02776 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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PF4P02776 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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PF4P02776 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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PF4P02776 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PF4P02776 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PF4P02776 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PF4P02776 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PF4P02776 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PF4P02776 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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PF4P02776 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PF4P02776 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PF4P02776 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PF4P02776 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PF4P02776 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PF4P02776 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PF4P02776 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PF4P02776 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PF4P02776 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PF4P02776 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PF4P02776 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PF4P02776 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PF4P02776 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PF4P02776 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PF4P02776 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PF4P02776 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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