Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KDM4BO94953 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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KDM4BO94953 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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