Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms