Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP10AO60312 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP10AO60312 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms