Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX5O60225 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX5O60225 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX5O60225 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX5O60225 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX5O60225 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX5O60225 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX5O60225 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX5O60225 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX5O60225 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX5O60225 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX5O60225 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX5O60225 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX5O60225 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX5O60225 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX5O60225 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX5O60225 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX5O60225 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSX5O60225 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSX5O60225 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSX5O60225 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSX5O60225 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSX5O60225 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSX5O60225 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSX5O60225 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSX5O60225 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSX5O60225 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX5O60225 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX5O60225 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms