Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCO2O43819 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCO2O43819 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms