Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBDO15205 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms