Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SYNJ2O15056 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms