Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F3O00716 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F3O00716 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F3O00716 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F3O00716 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F3O00716 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F3O00716 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F3O00716 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F3O00716 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F3O00716 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F3O00716 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F3O00716 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F3O00716 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F3O00716 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F3O00716 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F3O00716 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F3O00716 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F3O00716 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F3O00716 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F3O00716 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F3O00716 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F3O00716 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F3O00716 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F3O00716 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F3O00716 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F3O00716 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F3O00716 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F3O00716 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F3O00716 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F3O00716 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F3O00716 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F3O00716 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms