Protein–RNA interactions for Protein: O00445

SYT5, Synaptotagmin-5, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT5O00445 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT5O00445 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT5O00445 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT5O00445 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT5O00445 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT5O00445 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT5O00445 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT5O00445 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT5O00445 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT5O00445 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT5O00445 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT5O00445 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT5O00445 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT5O00445 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT5O00445 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT5O00445 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT5O00445 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT5O00445 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT5O00445 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT5O00445 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT5O00445 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT5O00445 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT5O00445 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT5O00445 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYT5O00445 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT5O00445 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT5O00445 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT5O00445 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms