Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
H7C1D1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.99
H7C1D1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C1D1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C1D1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
H7C1D1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H7C1D1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
H7C1D1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H7C1D1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H7C1D1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H7C1D1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H7C1D1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H7C1D1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H7C1D1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H7C1D1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H7C1D1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H7C1D1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H7C1D1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H7C1D1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H7C1D1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H7C1D1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H7C1D1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H7C1D1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H7C1D1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H7C1D1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H7C1D1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H7C1D1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H7C1D1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H7C1D1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H7C1D1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H7C1D1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H7C1D1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms