Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E9PCH4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E9PCH4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E9PCH4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E9PCH4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E9PCH4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E9PCH4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E9PCH4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E9PCH4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
E9PCH4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E9PCH4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PCH4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PCH4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PCH4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PCH4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PCH4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PCH4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PCH4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PCH4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PCH4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PCH4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PCH4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PCH4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PCH4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PCH4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PCH4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PCH4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PCH4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PCH4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
E9PCH4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
E9PCH4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
E9PCH4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
E9PCH4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
E9PCH4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
E9PCH4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
E9PCH4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
E9PCH4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
E9PCH4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
E9PCH4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
E9PCH4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
E9PCH4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
E9PCH4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
E9PCH4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
E9PCH4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
E9PCH4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
E9PCH4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
E9PCH4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
E9PCH4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
E9PCH4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
E9PCH4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
E9PCH4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
E9PCH4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
E9PCH4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
E9PCH4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
E9PCH4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
E9PCH4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
E9PCH4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
E9PCH4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PCH4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PCH4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PCH4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PCH4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PCH4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PCH4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PCH4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PCH4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PCH4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PCH4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PCH4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PCH4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PCH4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PCH4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PCH4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PCH4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PCH4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PCH4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PCH4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PCH4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PCH4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PCH4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PCH4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PCH4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PCH4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PCH4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PCH4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PCH4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PCH4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PCH4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PCH4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PCH4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PCH4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PCH4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PCH4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
E9PCH4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E9PCH4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E9PCH4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E9PCH4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E9PCH4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
E9PCH4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E9PCH4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms