Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHMG1C9JSJ3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms